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植物次生代謝組

次生代謝物是植物生命活動十分重要的物質,與植物防御病蟲害及應對環境脅迫密切相關。基于廣泛靶向代謝組技術,邁維建立了包括3500多種次生代謝物的數據庫,助力于植物次生代謝組學研究。
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  1.產品簡介:

  次生代謝物是植物生命活動十分重要的物質,與植物防御病蟲害及應對環境脅迫密切相關。基于廣泛靶向代謝組技術,邁維建立了包括3500多種次生代謝物的數據庫,助力于植物次生代謝組學研究。

  應用方向:

   植物次生代謝物成分鑒定

   植物次生代謝物通路研究

   植物抗病蟲害研究

   藥用植物活性成分鑒定

   植物藥用功能與作用機制研究

 

  2.技術路線:

 

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  技術優勢:

   數據庫大:包含3500多種物質,TCM領域最大數據庫

   數據庫全: 60科400多個物種構成,覆蓋常見物種

   物質種類多:包括萜類400多種,生物堿800多種,香豆素180多種,甾體200多種… …

   定性準確:自主研發AI-EPI二級譜匹配方法,項目樣本物質二級譜與公司數據庫二級譜逐一智能匹配

   定量準確:三重四級桿MRM模式,定量黃金標準,準確檢測物質相對含量

 

  3.樣品要求:

  1.取樣建議

  a. 葉片、莖、花等組織,取下后立即放入液氮中速凍2min以上,然后轉移到-80℃保存,避免反復凍融。較大葉片需要用剪刀快速剪碎。

  b. 地下組織(根、塊莖等),將分離出的樣本快速用滅菌水清洗,吸水紙吸走多余的水分后,立即放入液氮中速凍2min以上,然后轉移到-80℃保存。塊根等組織,需要切成 1-2cm 大小塊狀。

  c. 果肉、果皮組織,如果野外現場不具備分離條件,需盡快(30min內)轉移至室內,低溫條件下將分離果皮或果肉切成 1-2cm 塊狀,立即放入液氮中速凍2min以上,然后轉移到-80℃保存。

  d. 細胞樣本,取樣后離心去除培養基,立即放入液氮中速凍2min以上,轉移到-80℃保存。

  2.混合取樣

  取樣時為了保證樣品的準確性和減少系統誤差,每份樣品選取 3 株以上長勢一致的材料混樣。以水稻葉片為例:取同一時期,表型基本一致的同一部位1片葉片,同時取6株,放入10ml離心管中,迅速放入液氮中。

  3.樣品量與生物重復

  a.每份樣品取鮮樣不低于3g,干樣不低于1g,細胞樣品細胞量不低于107。

  b.每組至少3個生物學重復,準備備份。

  4.儲存與運輸

  -80℃保存,足量干冰運輸,避免反復凍融,干冰建議用量 5kg/天(根據樣本運輸需要時間計算)。

 

  4.案例分析

  案例分析:桃兒七中鬼臼毒素合成通路的代謝及轉錄分析

  鬼臼毒素是是抗腫瘤藥物依托泊苷的前體,但其生物合成途徑中只有一部分是已知的。作者利用轉錄組和代謝組技術,對鬼臼毒素途徑中的生物合成基因進行了鑒定。選擇了29個候選基因在煙草中組合表達,并鑒定了6種途徑酶。通過在煙草中共表達10個基因,重建了(-)-4'-desmethylepipodophyllotoxin的途徑,這是一種天然產生的木脂素,是依托泊苷的直接前體,與鬼臼毒素不同的是,它是一種有效的拓撲異構酶抑制因子。最終,作者完成了鬼臼毒素完整的合成通路,并且實現了體外煙草中鬼臼毒素的合成。

 

 

桃兒七中鬼臼素的生物合成途徑

  5.參考文獻:

  Lau W, Sattely ES.Six enzymes from mayapple that complete the biosynthetic pathway to the etoposide aglycone.Science. 2015,349(6253):1224-1228.

 

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