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農學常見問題

我們主要使用LC-MS/MS與GC-MS進行代謝物檢測,部分檢測會使用到600 MHz NMR。

目前效率最高的代謝物檢測方法是基于LC-MS/MS平臺的“廣泛靶向代謝組”技術,該方法整合傳統靶向、非靶向檢測技術優點,能同時定性、相對定量,實現了高通量、高靈敏度、靶向代謝物檢測。一次檢測數百種代謝物,且主要為中低豐度次生代謝產物。

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農學常見問題
2019-08-30 11:40:34
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農學常見問題
2019-08-30 11:40:22

我們利用標準品比對等多種手段,建立了上千種代謝物的LC-MS/MS數據庫。庫里包括酚胺類、萜類、生物堿、黃酮類、激素及其衍生物、氨基酸及其衍生物、核苷酸及其衍生物、脂肪酸等。不同物種、不同組織能鑒定到的代謝物不一樣,通常是一百種至數百種。

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農學常見問題
2019-08-30 11:40:22
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2019-08-30 11:40:09

將測序數據與代謝組數據結合,進行基因定位、研究基因功能、搞清楚關鍵性狀的核心代謝通路。利用該技術我們近兩年在Nat Genet、Nat Commun、PNAS、Plant Cell、Plant J、Curr Opin Plant Biol等雜志發表代謝組學相關論文多篇。

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農學常見問題
2019-08-30 11:40:09

非靶向一般是檢測到2000-3000的質譜峰,而非代謝物,需要對質譜峰搜庫比對鑒定代謝物,往往最終能鑒定到的物質不多。且能明確分離到的峰都是檢測信號強度10000到100000的,基本上以高豐度的初生代謝物為主。

廣泛靶向檢測的信號低至100,也就是說靈敏度是非靶向的100倍,這樣能檢測到大量的低豐度、次生代謝物,同時通過我們的庫及其他鑒定手段,可以鑒定出代謝物是什么。

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農學常見問題
2019-08-30 11:39:55

環境影響代謝物豐度是毫無疑問的,因此實驗要求控制環境變量,同一批實驗要在同一地區、同一時間混合采樣。

不過并非代謝組實驗就一定要取不同地點、不同年份,因為這是組學研究,數據量大,是從海量數據中找差異,因此把握主要矛盾,同一批次控制好環境變量,就會找到有價值的差異;另外,我們的方法靈敏度高,定量準,鑒定到的代謝物在不同樣本間差異大(10-10000倍),十分有利于排除環境變量的影響從而找到有價值的差異信息。

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農學常見問題
2019-08-30 11:39:40
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2019-08-30 11:39:25

請參考網站“技術支持----樣品要求”部分。

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2019-08-30 11:39:25
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